追加です。

今年、2023.01.27には、出来たと思われます。

実際フォルダコピーしたが、その方法の記憶が定かでない・・今後も毎年必要です。

同様な経験ありましたら、よろしくお願いします。

　
私のサイト（ バージョン: 1.14.2 ）で検証しましたが、現象を再現できず、
ダウンロードした時のフォルダ名「A」がそのまま、
フォルダ「B」の中で展開して出現しました。
　
　｜－フォルダ名「A」 （←元フォルダ）
　｜　　　｜－ いくつかのファイル群
　｜
　｜－フォルダ名「B」－フォルダ名「A」 （←展開フォルダ）
　｜　　　　　　　　　　　　｜－ いくつかのファイル群

　
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（さくらのレンタルサーバーにある）Connect-CMSのキャビネット上で
zipファイルを作るほか、Windowsパソコンにインスト－ルされているソフトで
zipファイルを作ってアップロードしてみましたが、問題なく「元の日本語名」で
フォルダ「B」の中に表示されました。

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改善につながるかどうかは分かりませんが、さしあたり
Connect-CMSのバージョンを更新してみてはいかがでしょうか。
　

暮れのお忙しい中、検証ありがとうございます。

当方のサイトのバージョンは1.6.0 なので、アップデートは大いに解決の可能性がありそうです。

即アップデートと行きませんが来年早々試したと思います。

またお世話になるかも知れませんがよろしくお願いします。